Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.9 ms