Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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