Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Use1Q9CQ56 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Use1Q9CQ56 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Use1Q9CQ56 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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