Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rtn4rQ99PI8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rtn4rQ99PI8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4rQ99PI8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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