Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim3Q99PE5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms