Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tm2d1Q99MB3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms