Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Klhl22Q99JN2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms