Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Slc8b1Q925Q3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc8b1Q925Q3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc8b1Q925Q3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms