Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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