Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Lrrtm1Q8K377 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Lrrtm1Q8K377 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Lrrtm1Q8K377 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Lrrtm1Q8K377 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Lrrtm1Q8K377 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrtm1Q8K377 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrrtm1Q8K377 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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