Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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