Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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