Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ercc8Q8CFD5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms