Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms