Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ss18l1Q8BW22 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ss18l1Q8BW22 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ss18l1Q8BW22 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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