Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms