Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Nop53Q8BK35 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Nop53Q8BK35 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Nop53Q8BK35 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Nop53Q8BK35 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Nop53Q8BK35 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop53Q8BK35 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Nop53Q8BK35 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nop53Q8BK35 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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