Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Slc5a7Q8BGY9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Slc5a7Q8BGY9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Slc5a7Q8BGY9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Slc5a7Q8BGY9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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