Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Avl9Q80U56 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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