Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf7ipQ7TT18 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms