Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms