Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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