Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GcsamQ6RFH4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms