Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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