Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hes3Q61657 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hes3Q61657 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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