Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ifi47Q61635 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifi47Q61635 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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