Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot7Q60809 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms