Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Utp20Q5XG71 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Utp20Q5XG71 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Utp20Q5XG71 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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