Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms