Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms