Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.4 ms