Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm36670-202ENSMUST00000210400 1405 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cab39l-206ENSMUST00000225595 1380 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms