Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ctdnep1Q3TP92 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ctdnep1Q3TP92 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ctdnep1Q3TP92 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ctdnep1Q3TP92 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ctdnep1Q3TP92 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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