Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms