Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col24a1Q30D77 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms