Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms