Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc21bQ0HA38 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc21bQ0HA38 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms