Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnnm1Q0GA42 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnnm1Q0GA42 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms