Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
MitfQ08874 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms