Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms