Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NfiaQ02780 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NfiaQ02780 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NfiaQ02780 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NfiaQ02780 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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