Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mc1rQ01727 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms