Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms