Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shc1P98083 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms