Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SgcgP82348 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SgcgP82348 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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