Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Irx1P81068 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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