Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms