Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd13P70217 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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