Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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