Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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